Dentre as bactérias autótrofas, há aquelas que realizam quimiossíntese, chamadas de bactérias quimioautotróficas, e as que realizam fotossíntese bacteriana, chamadas de bactérias fotoautotróficas

As bactérias quimioautotróficas utilizam a energia das reações de oxidação de compostos inorgânicos para formar substâncias orgânicas

As sulfobactérias são dotadas de uma clorofila especial chamada de bacterioclorofila e, diferentemente das demais fotoautotróficas, essas bactérias não retiram o hidrogênio da água, e sim de compostos que contêm enxofre

As cianobactérias são bactérias quimioautrotróficas. Elas são consideradas muito importantes por terem a capacidade de colonizar áreas inóspitas, como rochas, solo pobre em nutrientes

As proclorófitas possuem clorofila do tipo a e do tipo b, mesma clorofila encontrada em algas e vegetais, e a fotossíntese que realizam se assemelha muito à fotossíntese que as plantas realizam