As bactérias do gênero Rhizobium que se encontram nas raízes de plantas leguminosas, como por exemplo, o feijão e o milho, é que transformam o nitrogênio atmosférico em sais nitrogenados (nitrito e nitrato) para as plantas, ou seja, formas permissivas de assimilação química

As bactérias dos gêneros Nitrossomonas e Nitrobacter transformam, respectivamente, a amônia (NH3) liberada pela urina dos animais em nitrito e o nitrito em nitrato, o que aumenta a fertilidade do solo

As bactérias, juntamente com os fungos, realizam o processo de decomposição transformando a matéria morta e devolvendo-a ao solo sob a forma de matéria orgânica

As cianobactérias através do processo fotossintético são as grandes propiciadoras de oxigênio livre na atmosfera

Elas ajudam a controlar os insetos que atacam as plantações - o que nós denominamos de controle biológico ou natural de pragas, um exemplo é a espécie Bacillus thuringensis