RT-PCR refere-se a Reverse Transcriptase, e é feita apartir de RNA. O “Q” de q-PCR refere-se a quantitativo, já que essa técnica permite a quantificação do DNA presente na amostra analisada.

A técnica de RT-PCR parte de uma fita de DNA e a transforma em RNA, chamado de C-RNA, o RNA complementar ao molde presente na amostra

A técnica de RT-PCR refere-se ao tempo em que a reação é lida, que ocorre simultaneamente, ou seja, em tempo real.  

A q-PCR é uma reação qualitativa, ou seja, não fornece dados de quantificação do DNA presente na amostra analisada.

A RT-PCR é feita com sondas específicas lidas por emissão de fluorescência e a q-PCR é realizada com o uso de uma enzima denominada Reverse Transcriptase, que permite a quantificação do material genético.